Bij het ontstaan en de behandeling van depressies speelt serotonine een belangrijke rol. De bouwsteen van serotonine is tryptofaan (amino-indolpropionzuur), een essentieel aminozuur dat niet door het lichaam zelf wordt aangemaakt. Met behulp van Acute Tryptofaan Depletie kan worden onderzocht in hoeverre veranderingen in de serotonine-huishouding kunnen leiden tot veranderingen in symptomen die min of meer gerelateerd zijn aan depressie. Met deze methode wordt via inname van een aminozuurmengsel kunstmatig een tekort aan tryptofaan en (daardoor) aan serotonine geïnduceerd. Linda Booij en Willem Van der Does beschrijven in hun artikel de effecten van tryptofaandepletie op stemming en cognitieve functies.
