De wetenschappelijke activiteit in het Sophia Kinderziekenhuis in Rotterdam was vier jaar geleden ondergebracht in zeven tot tien onderzoeksprogramma's. De programma's waren door de medische faculteit bepaald en niet allemaal logisch verdeeld. Het Sophia Kinderziekenhuis heeft echter een goede traditie opgebouwd in het verrichten van wetenschappelijk onderzoek. De afgelopen vijf jaar was de afdeling jaarlijks verantwoordelijk voor 100 tot 120 internationale publicaties die gepubliceerd zijn in peer reviewed journals, en verschijnen ieder jaar ongeveer 10 à 12 proefschriften vanuit de afdeling Kindergeneeskunde. Het grote dilemma bij onderzoek in de kindergeneeskunde is dat het meestal niet binnen de afdeling zelf is georganiseeerd, maar meestal is gegroepeerd rond bestaande deelspecialismen, zoals we die kennen binnen de interne geneeskunde. Een groot nadeel van het denken in subspecialismen is dat door de omvang de kindergeneeskundecomponent in het geheel van de facultaire lijnen vaak betrekkelijk klein is.
